高迁移率族蛋白B1 (high mobility group box1 protein, HMGB1，NP_002119)是35年前发现的存在于真核细胞核内的非组蛋白染色体结合蛋白，因其在聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)中迁移速度快而得名。HMGB1是一个含有215个氨基酸残基的单链多肽，高度保守，N端富含带正电荷的赖氨酸，C末端富含带负电荷的天门冬氨酸和谷氨酸，又称酸性尾巴，分子量约为24 894 Da。从氨基端到羧基端的结构依次为9—79氨基酸残基的A box，95—163氨基酸残基的B box和186—215仅含谷氨酸和天门冬氨酸残基的受体结合模体。结构功能分析显示，HMGB1的B box是发挥炎症的功能区域，A box是B box的拮抗位点。A box和B box都能够与DNA结合，并参与DNA双链的折迭与扭曲。